text.skipToContent text.skipToNavigation

EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits

采用96孔板规格,对各种起始材料进行超快速、高效的亚硫酸氢盐转化

  • 优化的操作流程对胞嘧啶转化率超过99%
  • 在少至30分钟内完成有效地亚硫酸氢盐转化
  • 可用于基因组DNA、全血、培养细胞、组织样本和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片
  • 96孔板规格可进行高通量转化和DNA纯化
  • 独特的DNA Protect技术可防止DNA降解

EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits是一个协调的系统,可在少至30分钟内将未甲基化的胞嘧啶高效转化成尿嘧啶,起始材料选择也有出色的灵活性。简化的样本裂解操作流程和直接的DNA亚硫酸氢盐转化使转化过程快速、省力,样本包括全血、培养细胞、组织样本、基因组DNA和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片。创新的DNA Protect技术确保有效的DNA变性而不会降解,得到高产量DNA和可重复性结果。基于96孔板的操作流程可进行超快速、高通量的DNA亚硫酸氢盐转化,可用离心机或真空底座处理。

Cat No./ID: 59720
EpiTect Fast 96 Bisulfite Kit
2 x EpiTect 96-well Plates, Bisulfite Solution, DNA Protect Buffer, Carrier RNA, Buffers
Cat No./ID: 59740
EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit
Deparaffinization Solution, Lysis Buffer, Proteinase K, 2 x EpiTect 96-well Plates, Bisulfite Solution, DNA Protect Buffer, Carrier RNA, Buffers

EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或治疗。


0
高效的X染色体DNA胞嘧啶转化。
使用EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit对K562基因组DNA进行亚硫酸氢盐转化,使用不含胞嘧啶的引物对X染色体上的100 bp扩增子进行扩增,可同时扩增未转化和亚硫酸氢盐转化的DNA。PCR产物被克隆到载体上,Sanger测序鉴定转化的胞嘧啶。分析了1252个胞嘧啶,得到的胞嘧啶转化率高达99.8%。由于基因组DNA是来自女性,转化率非常高;因此,2个X染色体中的一个是高度甲基化的。
1
EpiTect Fast 96 DNA Bisufite Kit实验流程。
EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit实验高效、简洁,能够在1小时内完成亚硫酸氢盐转化和基因组DNA回收。
2
EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit实验流程。
完成去石蜡、裂解和去交联步骤后,EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit可完成整个亚硫酸氢盐转化。
3
EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit实验流程。
完成样本裂解步骤后,EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit可完成整个亚硫酸氢盐转化。
4
分析亚硫酸氢盐转化后的DNA片段大小。
使用EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit完成亚硫酸氢盐转化后,1 µg基因组DNA的片段化水平最低,大小分布在几百碱基对到大于6 kb之间,而其他方法得到的片段多数为500 bp至1 kb之间。样本在Agilent RNA 6000 Nano Chip上分析。
5
出色的亚硫酸氢盐转化。
使用EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit或来自Supplier Z的试剂盒进行基因组DNA亚硫酸氢盐转化后,未转化的基因组DNA和亚硫酸氢盐转化的DNA共同扩增,再通过焦硫酸测序对每个胞嘧啶的转化率进行定量。[A]分析2 µg DNA时,EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit得到的结果与Supplier Z试剂盒相当。[B]但是,当分析少量DNA(10 ng)时,Pyrogram中的4个胞嘧啶残基表明,EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit得到的结果比来自Supplier Z的试剂盒的明显更好。(使用来自Supplier Z的试剂盒不能进行亚硫酸氢盐转化的每个胞嘧啶残基与EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit的百分比:分别为12% vs. 2%, 5% vs. 1%, 37% vs. 9%和11% vs. 2%)。
6
DNA Protect Buffer。
DNA Protect Buffer加入到亚硫酸氢盐转化反应体系后会从绿色变成蓝色,表明混合充分且pH值合适。
8
EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits实验方案。
根据样本类型不同,需使用特定试剂盒和操作流程用于亚硫酸氢盐转化DNA。试剂盒含有DNA提取的优化缓冲液和亚硫酸氢盐转化DNA所需的试剂。
Performance
高效亚硫酸氢盐转化

在甲基化分析中,对DNA亚硫酸氢盐处理,将未甲基化的胞嘧啶转化成胞嘧啶是最关键的步骤,因为反应效率会对下游分析的可靠性造成很大影响。EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kits含有的创新型Bisulfite Solution可进行超快速、高效的亚硫酸氢盐转化,甚至可处理难分析的样本,如来自女性样本的X染色体基因组DNA,因为2个X染色体中有一个是高度甲基化的(参见"Highly efficient cytosine conversion of X chromosome DNA")。焦磷酸测序对胞嘧啶转化定量分析表明,与其他供应商的试剂盒相比,EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kit的转化效果明显更好,特别是当起始材料的量很有限时(参见"Superior bisulfite conversion")。

DNA片段化减少

完全亚硫酸氢盐转化所需的剧烈条件通常会造成高度DNA片段化和样本损失,导致DNA产量低、高度片段化DNA以及不可重复的转化率。QIAGEN独特的DNA Protect Buffer可防止DNA降解,与其他供应商的试剂盒转化的DNA相比,可获得更大片段大小的完全转化DNA(参见"Analysis of DNA fragment sizes after bisulfite conversion")。

Principle

DNA样本的快速、完全的亚硫酸氢盐转化对于准确的DNA甲基化分析是必需的。EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kits含有的创新型Bisulfite Solution可在少至30分钟内完成高效的亚硫酸氢盐转化。简化的样本裂解和转化操作流程可对DNA进行有效纯化和亚硫酸氢盐转化,而独特的DNA Protect技术可最大程度减少亚硫酸氢盐处理时的DNA片段化。3种EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits相互联系,形成的完整系统可对一系列起始材料的DNA进行直接亚硫酸氢盐转化(参见"Interconnected protocols of the EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits")。但每种试剂盒特有其独特之处,重点处理特定样本类型,各自含有需要的所有缓冲液和试剂。每个试剂盒的组分可有效裂解样本,减少DNA损失,进行完全亚硫酸氢盐转化,并在转化及DNA回收过程中形成有效保护。

快速亚硫酸氢盐转化

EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits提供非常快速、简洁的操作流程,可有效转化并纯化来自基因组DNA、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片、血液、细胞或组织样本中的DNA。试剂盒含有高浓度的Bisulfite Solution,将未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶所需的时间从几个小时减少到了30分钟,含有的制备缓冲液无需在亚硫酸氢盐处理前分离DNA。而且,亚硫酸氢盐热循环程序提供优化的孵育步骤,可使DNA热变性、磺基化以及胞嘧啶脱氨,使胞嘧啶转化率超过99%。胞嘧啶转化的最后一个步骤是脱磺基化,此过程可在纯化流程时简单完成。

DNA Protect Buffer

样本DNA的快速、完全的亚硫酸氢盐转化对于正确确定甲基化模式是最关键的。这个过程需要将DNA在高浓度亚硫酸氢盐、高温、低pH条件下孵育。这些剧烈的条件经常造成高度DNA片段化和纯化时的DNA损失。普通亚硫酸氢盐转化需要大量的起始DNA,以弥补转化时的DNA降解和纯化时的DNA损失,这常常导致DNA产量低、片段化高和不可重复的转化率。使用EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits时,独特的DNA Protect Buffer可在亚硫酸氢盐转化时防止由于高温、低pH值造成的DNA片段化。此缓冲液还可使DNA有效变性,得到完全胞嘧啶转化所需的单链DNA。DNA Protect Buffer含有方便的pH指示剂,可确保胞嘧啶转化时具有正确的pH(参见"DNA Protect Buffer")。

福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的脱蜡

从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本中抽提DNA的第一步是脱蜡,石蜡先是被熔解再被去除,暴露出的样本进行后续的裂解液和蛋白酶K处理。EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit中含有的新型化学试剂Deparaffinization Solution可优化福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片的脱蜡、裂解和解交联过程。Deparaffinization Solution可获得高DNA回收率,因为溶液在样本上时就可进行蛋白酶K消化。由于无需沉淀福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本或去除含有石蜡的上清,可避免脱蜡时的样本损失风险。

Procedure

 EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kit操作流程包括几个简单的步骤:从样本中制备DNA,未甲基化胞嘧啶的亚硫酸氢盐转化;转化的单链DNA结合到EpiTect 96 Plate膜上;洗涤;膜上结合DNA的去磺基化;漂洗膜上结合DNA,去除去磺基化试剂;从96孔板上洗脱纯化的转化DNA。福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片、全血、细胞培养基或组织样本的制备是不同的,但是提取DNA的亚硫酸氢盐转化流程对所有样本类型都是相同的(参见"Interconnected protocols of the EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits")。所有实验方案可获得相同的胞嘧啶转化率,转化DNA的纯化也能获得同等DNA回收,与DNA起始量无关。

试剂盒描述

EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit

EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit包括精心配制的缓冲液和试剂,可对基因组DNA进行简洁、有效的亚硫酸氢盐转化和对转化DNA的回收(参见"EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit procedure")。新型Bisulfite Solution可在少至30分钟内进行完全亚硫酸氢盐转化,运用DNA Protect技术和EpiTect 96 Plates可通过离心管或真空歧管获得很少降解的完全转化DNA。EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit可转化1 ng–2 µg DNA。

EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit

EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit可处理福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织,EpiTect Fast 96 FFPE Lysis Kit含有的专门缓冲液可有效去石蜡并裂解福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片(参见"EpiTect Fast 96 FFPE Bisulfite Kit procedure"),EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit可对提取的DNA进行快速、有效的亚硫酸氢盐转化。实验方案包括的优化步骤便于DNA结合,可用于单个福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片(厚度为10 µm)。从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织中提取DNA很难避免DNA片段化,后续亚硫酸氢盐处理时的剧烈条件更会加重片段化。QIAGEN提供可靠地DNA Protect技术可最大程度减少转化反应造成的片段化,获得更高产量的亚硫酸氢盐转化DNA。

EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit

EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit可处理全血、培养细胞或组织样本,EpiTect Fast 96 LyseAll Lysis Kit(参见"EpiTect Fast 96 LyseAll Bisulfite Kit procedure")含有新型裂解缓冲液,EpiTect Fast 96 DNA Bisulfite Kit可对提取DNA进行亚硫酸氢盐转化。实验方案包括的优化步骤便于DNA结合,独特配制的裂解缓冲液使DNA从样本中释放更为简洁。此试剂盒可用于0.5–20 µl血液或10–105个细胞(少至60 pg DNA)。

Applications
EpiTect Fast 96 Bisulfite Conversion Kits可对各种起始材料的DNA进行快速、有效的亚硫酸氢盐转化,非常适合DNA甲基化分析的技术,包括:
  • PCR:终点、real-time和甲基化特异性PCR
  • 亚硫酸氢盐测序(直接和克隆)
  • COBRA (Combined Bisulfite Restriction Analysis)
  • 焦磷酸测序
fragment fix placeholder