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PyroMark Q24 Advanced Software

将PyroMark Q24升级至PyroMark Q24 Advanced的分析软件
  • 先进的技术、软件和化学试剂,可用于长序列分析
  • 连续CpG或CpN位点的定量甲基化分析
  • 任意序列位置的改进的序列差异定量
  • 简单且更佳的碱基检出功能
  • 同一仪器和同一运行中的Assay通用性
PyroMark Q24 Advanced改进了焦磷酸测序技术,可提供比以往更佳的实时测序检测和定量。用户可使用PyroMark Q24 Advanced Software升级现有的PyroMark Q24,充分利用更加先进的技术和功能。该软件有4个分析模块:AQ:等位基因定量;SNP:基因分型;CpG:CpG或CpN位点的甲基化;SEQ:未知序列的碱基检出。
Cat No./ID: 9022779
PyroMark Q24 Advanced Software
Analysis software for upgrading PyroMark Q24 systems
PyroMark Q24 Advanced和PyroMark Q24 Advanced Software应与相应的QIAGEN试剂盒配合使用,适用于试剂盒用户手册中指定的应用。如果将PyroMark Q24 Advanced Software与非QIAGEN的试剂盒配合使用,用户应自行确认是否适用于相关应用。
0
对CpN位点的甲基化进行定量检测。
Pyromark Q24 Advanced的新型CpN模式能够检测不属于CpG位点的胞嘧啶残基进行甲基化分析。可以独立选择要分析的位置。图中例子为对第一个位置的CpN位点的分析(CpA),之后是对两个CpG位点的分析。
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新增的警告信息。
PyroMark Q24 Advanced Software在反应出现问题或系统检测到某一孔的试剂不匹配时会发出警告信息。这些警告可能与某一位置或整个反应有关。出问题的孔的标签会由蓝色变为黄色,表明应进行检查,孔内的试剂可能仍可使用;当变为红色时,表明未通过检查,试剂不可使用。
2
故障排除推荐。
PyroMark Q24 Advanced Software提供警告信息选择。这一新的信息窗口包含对警告的简单描述,并推荐故障解决方法。
Performance
CpN甲基化定量
PyroMark Q24 Advanced的CpN分析模式能够实现对不属于CpG位点的胞嘧啶残基进行甲基化分析。CpN和CpG位点的分析可在一次焦磷酸测序反应中进行。可在反应设置阶段,分别选择待分析的位点(参见Quantification of CpN methylation)。

便利的分析工具
PyroMark Q24 Advanced是一款直观、友好的分析软件,能够进行便利的分析。如果在运行中出现错误,或系统检测到试剂有异,会自动报错,提示出错的孔(参见Additional warning information)。“Warning Info(警告信息)”按钮可提供更多信息,以及纠错的推荐方案,防止后续反应中再次出现问题(参见Troubleshooting recommendations)。

较长的焦磷酸测序运行和更高的准确度
PyroMark Q24 Advanced采用了改进的化学试剂和仪器操作算法,大大增加了读取长度和碱基检出功能的准确度,可轻松实现较长的从头测序运行分析。此前,读取长度受到测序反应中的背景峰和较低的光信号的限制。已升级的PyroMark Q24 Advanced化学试剂和算法可降低该背景峰,从而提高读取长度和可靠性。根据待分析序列的不同,只需一次PyroMark Q24 Advanced反应即可获得高度准确的140个或更多碱基的读取长度 (参见Long de novo sequencing runs)。
任意位置的更先进的甲基化分析
PyroMark Q24 Advanced可在任意序列位置实现改进的长片段序列甲基化定量。以前,远离测序引物的甲基化位点分析是无法确定的,但现在利用更长的读取长度和更高的准确度,可在整个测序运行中实现高度可靠的甲基化定量(参见Analysis of 16 CpG sites in a long sequence run)。
改进的同聚物测序准确度
DNA甲基化分析中的亚硫酸氢盐转化可导致核苷酸序列中频繁的poly T延伸,以前,由于这些位点的光信号定量的不确定性,在这种T同聚物之后直接进行CpG位点分析面临诸多难题。PyroMark Q24 Advanced具有更高的准确度,可在8个T核苷酸链之后甚至之中实现可靠的CpG甲基化定量(参见Improved methylation quantification in homopolymers)。
长片段序列的突变分析
PyroMark Q24 Advanced还可利用单个Assay实现可靠的多态性定量。由于单核苷酸多态性(SNP)及其他突变通常不相邻,因此传统的焦磷酸测序化学方法一般需要分析针对每个突变位点的单独的Assay。全新的PyroMark Q24 Advanced化学方法可实现更长片段分析,在一次运行中实现多个突变或SNP的可靠分析(参见Quantitative mutation analysis in long sequence runs)。
Principle
用户可使用PyroMark Q24 Advanced Software升级现有的PyroMark Q24,充分利用更加先进的技术和功能。该软件与使用运行固件3.0以上的PyroMark Q24仪器兼容。请参阅“相关资料”选项卡下的《Upgrade to PyroMark Q24 Advanced》文件,了解升级的相关介绍。
Applications
焦磷酸测序在各学科的研究应用中发挥了愈来愈重要的作用。不论是检查病原体中的抗药性的产生、基因表达调控中表观遗传学DNA甲基化的作用、家畜中特定表型的遗传标志物,还是线粒体DNA法医样本中的多态性,PyroMark Q24 Advanced均可提供功能强大且通用的基因和表观遗传学变异分析。此外,由于焦磷酸测序整合了序列检测和定量,提高的分析分辨率可促进新发现的诞生。

产品对比
PyroMark Q24 Advanced PyroMark Q24
通量 1–24 个样本 1–24个样本
体积 25 µl 25 µl
PCR产物需要量 5–10 µl
(~0.5–3 pmol产物)
5–10 µl
(~0.5–3 pmol产物)
读长(取决于Assay和序列) 10–140 bp以上 10–80 bp
应用软件 PyroMark Q24 Advanced SW
(需要固件1.5.6903或更高)
PyroMark Q24 SW 2.0
软件功能 SEQ(从头测序)
CpG/CpN甲基化
SNP
AQ
SQA (从头测序)
CpG甲基化
AQ/SNP
主要应用 复杂突变分析
表观遗传学(CpG和CpN分析)
耐药性分析和微生物鉴定
突变分析
耐药性分析
兼容试剂 PyroMark Q24 Advanced Reagents
PyroMark Q24 Advanced CpG Reagents
PyroMark Q24 Gold Reagents
灵敏度 2%的突变
98% wt
2%的突变
98% wt

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操作软件 (2)
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PyroMark Q24 Advanced Software version 3.0.1 is compatible with Windows 7 and Windows 10 (64 bit) operating systems. This software may only be downloaded by registered users with a valid PyroMark Q24 Advanced Software license and registered PyroMark Q24 Advanced instrument. If you do not have a valid software license, contact your QIAGEN sales representative.
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应用说明 (1)
A Pyrosequencing method for the forensic identification of tissue source using QIAGEN’s PyroMark Q24 Advanced system.
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