更长的焦磷酸测序运行和更高的准确度
PyroMark Q24 Advanced采用了改进的化学试剂和仪器操作算法，大大增加了读取长度和碱基检出功能的准确度，可轻松实现较长的从头测序运行分析。此前，读取长度受到测序反应中的背景峰和较低的光信号的限制。已升级的PyroMark Q24 Advanced化学试剂和算法可降低该背景峰，从而提高读取长度和可靠性。根据待分析序列的不同，只需一次PyroMark Q24 Advanced反应即可获得高度准确的140个或更多碱基的读取长度 （参见
Long de novo sequencing runs）。
任意位置的更先进的甲基化分析
PyroMark Q24 Advanced可在任意序列位置实现改进的长片段序列甲基化定量。以前，远离测序引物的甲基化位点分析是无法确定的，但现在利用更长的读取长度和更高的准确度，可在整个测序运行中实现高度可靠的甲基化定量（参见
Analysis of 16 CpG sites in a long sequence run）。
改进的同聚物测序准确度
DNA甲基化分析中的亚硫酸氢盐转化可导致核苷酸序列中频繁的poly T延伸，以前，由于这些位点的光信号定量的不确定性，在这种T同聚物之后直接进行CpG位点分析面临诸多难题。PyroMark Q24 Advanced具有更高的准确度，可在8个T核苷酸链之后甚至之中实现可靠的CpG甲基化定量（参见
Improved methylation quantification in homopolymers）。
长片段序列的突变分析
PyroMark Q24 Advanced还可利用单个Assay实现可靠的多态性定量。由于单核苷酸多态性（SNP）及其他突变通常不相邻，因此传统的焦磷酸测序化学方法一般需要分析针对每个突变位点的单独的Assay。全新的PyroMark Q24 Advanced化学方法可实现更长片段分析，在一次运行中实现多个突变或SNP的可靠分析（参见
Quantitative mutation analysis in long sequence runs）。