用于去除1–24个测序反应体系中未结合的染料终止剂

  • 快速的操作流程只需两步短暂离心
  • 即用型预水化凝胶过滤材料
  • 高效去除任何染料终止剂

DyeEx Kits提供离心柱或96孔板规格,应用凝胶过滤技术从测序反应体系中去除染料终止剂。将测序反应体系上载到预水化凝胶过滤材料中,短暂离心后,反应体系即可用于毛细管测序仪测序。未结合的染料终止剂则会滞留在凝胶基质中。

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DyeEx 2.0 Spin Kit (50)
50 DyeEx Spin Columns, Collection Tubes (2 ml)
63204
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DyeEx 2.0 Spin Kit (250)
250 DyeEx Spin Columns, Collection Tubes (2 ml)
63206
询价

DyeEx 2.0 Spin Kit适用于分子生物学应用。该产品不适用于疾病的诊断、预防或治疗。


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DyeEx 2.0 Spin实验流程。|DyeEx分离原理。|长片段测序。|出色的测序结果。|
快速离心步骤将储存缓冲液从离心柱中移出。上样测序样本,再次离心,将没有反应的染料终止剂去除。|DyeEx实验通过凝胶过滤,快速、高效的将未反应的染料终止剂从测序反应体系中去除。|使用DyeEx 96 Kit进行纯化,使用ABI PRISM BigDye Terminator Sequencing Kit对4.7 kb的质粒DNA进行测序。|在ABI PRISM 377 DNA Sequencer上使用ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit对QIAprep纯化获得质粒进行测序:[A]凝胶图和[B]测序结果图。测序反应使用DyeEx 96 Kit或乙醇沉淀法进行纯化。被测质粒来自基因组文库(乙醇沉淀,凝胶图),或来自pUC21(DyeEx 96 Kit和乙醇沉淀,测序结果图)。乙醇沉淀中残留的染料终止剂导致出现染料污斑(箭头所示处),进而导致序列不可读。|
性能

DyeEx Kits可去除10–20 µl测序反应体系中任意类型的染料终止剂,包括BigDye、dRhodamine染料、Rhodamine、DYEnamic ET和WellRED终止剂。片段回收后,测序反应可在任意类型的毛细管测序仪上完成。

高品质测序

DyeEx Kits经优化,用于快速简便的去除染料终止剂,确保高品质的测序结果。与之相反,通过乙醇沉淀进行测序反应体系的回收非常耗时(参见"Comparison of DyeEx procedure and ethanol precipitation")并且效率较低。无法高效去除染料终止剂将会导致测序数据上出现染斑,使得延伸序列不可读。使用DyeEx Kits进行反应体系的回收,可以确保上载到测序设备的反应体系不含染料终止剂。无染斑干扰,可轻松读通序列(参见"Superior sequencing results")。信号强度高可确保较长的序列读取长度(参见"Long-read sequence")。

DyeEx流程与乙醇沉淀的比较
操作流程  DyeEx 2.0 Spin Kit 乙醇沉淀
所需时间*
(12 个样本,离心规格)
10分钟 >45分钟
所需时间*
(用于96个样本的微孔板规格)
N.A. >60分钟
处理 即用型离心规格 多步移液操作
测序品质 ++  +
N.A.: 不适用
* 不包括凝胶装载前干燥样本所需时间(如适用).
使用标准的实验方案.
原理
DyeEx染料终止剂去除系统通过简单的离心柱流程,配合该流程中的凝胶过滤,快速高效的去除测序反应体系中未结合的染料终止剂。为了避免未结合的染料终止剂干扰测序结果的分析,因此去除染料终止剂非常重要。DyeEx凝胶过滤材料由带有均匀孔隙的球体组成,根据分子量对染料分子进行分离。当测序反应混合物上样到DyeEx柱的时候,染料终止剂扩散到孔隙内,并滞留在凝胶过滤材料中,而标记的DNA片段从球体间隙通过,由流出液中回收得到(参见"DyeEx separation principle")。
操作流程
DyeEx Kits可快速除去染料终止剂,因为其流程非常简单(参见"DyeEx 2.0 Spin procedure")。通过快速离心除去柱子中残留的缓冲液,然后上载测序样本,接着通过第二步离心除去未结合的染料终止剂。样本此时即可直接上载到毛细测序仪上,或经干燥,再溶解后上样到测序凝胶。
应用

回收后,测序反应可在任意毛细管测序仪上完成。

特点
参数
结合能力 10–20 µl
洗脱体积 10–20 µl
用于DyeEx Kits: Terminator removal, ABI PRISM 377, 373, 310, 3100, or 3700, MegaBACE 1000, or CEQ 2000 sequencers
规格 Tube/96-well plate
处理 Manual
去除<10mers、17–40mers的染料终止子蛋白 Dye terminator
样本类型:应用 Sequencing reactions
技术 Gel filtration

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试剂盒操作手册
1
For DyeEx 2.0 Spin Kit and DyeEx 96 Kit 
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参考文献
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